在真新镇休息了几天后，小智打算向城都联盟发起挑战了，而这刚好是过完元旦，也就是说新的一年开始了。
“小霞、小刚，我接下来要去城都联盟挑战了，不知道你们要不要一起去。”这天早上在吃早餐的时候，小智对小霞和小刚问道。
“皮卡~。”皮卡丘在和桌上的番茄酱奋斗，那是它的最爱。
“我当然会去了。”小霞立刻表态，“对了，城都地区在什么地方？”
“城都地区在关都地区的西部，那里有好几个道馆，只要得到徽章的话就可以参加城都联盟的联盟大会了。”小智介绍说，“小刚，你呢？”
“你们没有我是不行的，我也要去。”小刚已经从被甩的阴影中走出来了。
“好，那我们待会儿去大木博士那里和博士、小建说一声再走吧。”小智又说道，“妈，我要继续旅行了。”
“好，知道了，要加油哦，我会给你加油的，去大木博士那里记得向博士和小建问好，我会替你准备好东西的。”小智的妈妈笑着说道。
“嗯，我会把城都联盟的冠军奖杯带回来的。”
吃过早餐后，小智、小霞和小刚就带着皮卡丘和波克基古向大木博士研究所前进了。
“博士，我要去城都联盟挑战了，来和你说一声。”到了研究所后，小智就对一直忙着研究GS球的大木博士说道。
“哦，小智啊。”大木博士回过头看到原来是小智，“你要去城都地区啊，那要继续加油了。”
“对了，GS球的事有没有查出什么？”小霞看着GS球问道。
“还早的很呢。”小建指着电脑屏幕上的一连串问号说道。
“对了，小智你要去城都地区，那么麻烦你一件事，你到桧皮镇的时候，把GS球交给精灵球的制作大师钢铁先生，相信以他的才华也许会知道GS球的事。”大木博士在电脑上找出一张照片对小智说道。
“好，我知道了。”小智接过了GS球。
“小智，我会在研究所看你传来什么样的宝可梦。”小建笑着说道。
“嗯，我会加油的。”
“小智，你这次要带什么宝可梦？”大木博士这时问道。
“皮卡丘、哈克龙和蚊香蝌蚪吧。”小智想了想后说道，哈克龙是从迷你龙进化的那只小的，不是角上有“×”形痕迹的母亲哈克龙，而蚊香蝌蚪则是小智在这几天孵化的隐藏特性悠游自如的蚊香蝌蚪，虽然吉利蛋可以再次进化为幸福蛋，但是小智已经不打算让它进化了，而且自己的教练团也需要队医的存在，所以就让它留在了大木博士研究所。
“小智，给，这是哈克龙和蚊香蝌蚪的精灵球。”小建拿出两个精灵球递给了小智。
“谢谢。”
“小智，这是给你的饯别礼。”大木博士拿出一个红色的图鉴递给小智。
“是新的图鉴啊。”虽然小智不用图鉴查宝可梦的资料，但是作为身份证明还是很有必要的，小智接过了图鉴，并把它翻开，“确认ID，拥有者，真新镇的小智。”图鉴立刻就显示了小智的头像，并且传来电子的声音。
“小智，我们也准备好了。”刚才小霞和小刚去打电话了，小霞把刺龙王传回了华蓝道馆，现在带的是波克基古、玛瑙水母、可达鸭、蚊香君和化石盔，而小刚也把三合一磁怪和暴鲤龙传回了尼比道馆，只带着超音蝠和六尾。
“小智，你们要参加城都联盟，必须要先到若叶镇办理参加的手续才行，那里被称为开始之风吹拂的城市。”大木博士又对小智他们说道。
“嗯，我知道了。”小智当然知道，“好了，我们回家拿东西就要走了。”
“加油啊。”大木博士和小建对小智说道。
“妈，我要出发了。”回到家后，小智的妈妈也把小智的背包准备好了，小智拿好东西后，在门口对妈妈告别。
“小智，睡觉前一定要记得刷牙喔。”而小智的妈妈又说出了一直叮嘱小智的话。
“好了，知道了，那我们出发了。”
“伯母再见了。”小霞和小刚也对着小智的挥手道别。
“皮卡~丘~。”“叫尅古~。”当然还有皮卡丘和波克基古了。
“要加油哦。”小智的妈妈对着小智他们说道，而小智他们也和妈妈挥手告别向第一个城镇若叶镇前进了。
“这棵树刚刚才见过的。”就在小智他们快到若叶镇的时候，树林里出现了浓雾，而小刚这时指着前面的一棵树说道。
“啊，真的吗？”小霞听到后，立刻说道，“我们又迷路。”
“叫尅古~。”这时波克基古突然叫了一声就向一个方向飞去，而保姆皮也跟了上去。
“波克基古你要去哪里啊？”小霞立刻追了上去，而小智和小刚也在后面跟着。
“怎么了？”到了一个湖边后，小刚就看到前面的小霞停在那里。
“好漂亮啊。”小霞则是陶醉的看着前面湖中的蓝色宝可梦。
“那个是水君，极光宝可梦，是小霞最喜欢的水系的宝可梦，拥有连肮脏的浊水也能一瞬间净化的力量，据说是北风的化身，是传说中的宝可梦。”这时小智走过来说道。
“是传说中的宝可梦啊。”小刚感慨的说道。
“是水系的。”而小霞则是因为水系更加的兴奋。
“等一下。”这时水君跳跃着离开了，而小霞则是赶紧喊道，并且向前走去，没有想到，前面是一个滑坡，小霞滑了下去。
“小霞。”而小智则是想也没想的跟了下去，当然小刚也不会例外的。
“小霞，没事吧。”到了下面后，小智立刻担心地问道。
“没事，一切还好。”
“那就好。”小智放下心来。
“你们看是城市。”这时小刚突然喊道。
“这里有一块木牌。”小霞也走过去发现了一块木牌，“若叶镇，开始之风吹拂的城镇。”小霞念道，“太好了，我们终于到了。”
“是啊，我们的城都联盟之旅就要从这里开始了。”小智也很高兴，“我们去宝可梦中心登录吧。”
“这个城镇应该也有一个乔伊小姐吧。”小霞抱着波克基古说道。
“那我们快走吧。”小刚听到乔伊小姐顿时来了精神，第一个向城镇走去，小智和小霞紧随其后。
“午安。”刚到宝可梦中心，小刚就跑到前面说道。
“lucky~。”不过出来的不是乔伊小姐，而是吉利蛋。
“乔伊小姐呢？”小刚有点失望。
“我是宝可梦中心的乔伊。”吉利蛋按了一个按钮后，就出现了一个屏幕，而在屏幕上出现了乔伊小姐的影像。
“啊，乔伊小姐。”小刚看到乔伊小姐立刻犯花痴了。
“果然长的一模一样耶。”小霞看到后说道。
“现在我正在空木博士研究所，大概两个小时就会回来了，请你们大家暂时等一下吧。”屏幕上的乔伊小姐说道，原来是出门了。
“现在已经三点半了，有点晚了耶。”小霞看了看时间。
“我们去空木博士的研究所拜访看看吧。”小智觉得还是有必要去刷个脸的。
“好耶，我们赶紧去吧。”刚叔则是因为能见到乔伊小姐立刻说道，然后大家就找准了空木博士研究所的方向后出发了。
刚到空木博士的研究所就看到好多的警车停在前面，“到底发生了什么事？”小霞有点好奇发生了什么事情。
“君莎小姐，你工作辛苦了，我叫做小刚，请您多多指教。”小刚则是发现了前面的君莎小姐，跑上去搭讪去了，“我是为了要见你才特地到这里来的。”
“哎哎哎，我们的目的不是这个啦。”小霞则是把小刚拽走了。
“你好，我们是来拜访空木博士的。”小智走上去对君莎小姐说道。
“空木博士就在里面了。”君莎小姐微笑着回答说，然后小智他们就进了研究所。
“都是我太大意了，才惹出这种事来。”一进到研究所里，就看到一个穿着研究服的青年低着头说着。
“就是说啊，真是的，你要专心于研究没有关系，可是你至少也应该为新人训练家们考虑一下才对吧。”而乔伊小姐则是对那个人抱怨着。
“你们好，这里发生什么事了吗？”小智走上前询问。
“这个地方遭小偷了。”乔伊小姐回答说。
“宝可梦小偷？”而小霞和小刚则是吃惊。
“明天会有新人训练家从这里出发，可是打算给那个人的小锯鳄却被偷了。”君莎小姐也走了进来。
“小锯鳄？”小霞没听过这只宝可梦。
“哦，那是明天要跟这个火球鼠一起送给新人训练家的宝可梦。”空木博士抱出一只火球鼠。
“好可爱啊。”小霞立刻跑上前去看火球鼠。
“我是真新镇的小智，要向城都联盟挑战，所以来这里拜访一下空木博士。”小智对空木博士介绍说。
“啊，你就是小智啊。”听到小智的话，空木博士激动了起来，“作为我的老师的大木博士经常向我提起你呢，而且你为我们提供了很多的研究素材呢。”
“还好。”小智挠了挠头。
“君莎小姐。”这时一位工作人员抱着一块石板走了进来，“君莎小姐，没有采集到可疑人的指纹，不过找到了他们的脚印。”那个人向大家展示有脚印的石板。
“那个应该是喵喵的脚印，一个女人和一个男人的脚印。”小智一眼就认出来了，可惜没有小蓝偷杰尼龟。
“啊，是火箭队。”小霞立刻想到了老熟人。
“君莎小姐，请让我们也去寻找他们吧。”小刚觉得有火箭队的地方就需要他们出现，当然其实是他们出现的地方就会有火箭队。
“卡蒂狗可以从足迹的残留味道上找出对方在什么地方。”小智他们和君莎小姐一边跟着卡蒂狗向前跑，君莎小姐一边说道。
“火箭队，真的是你们。”卡蒂狗终于找到了火箭队他们，而火箭队三人正扭作一团，小锯鳄还咬在武藏的头发上，小霞立刻说道。
“小鬼头？”而火箭队看见小智他们后也很吃惊。
“火箭队，你们被逮捕了，立刻把那只小锯鳄给交出来。”君莎小姐拿出手铐说道。
“既然你让我们交出来。”“我们就偏偏不交出了。”“…………（火箭队经典台词）。”
“你们在说什么？”在火箭队说完后君莎小姐问道，然后火箭队就扑街了。
“少罗嗦，这个家伙我们要带走就对了，我要把它培育成最强的坏蛋。”武藏甩着咬在她头发上的小锯鳄说道。
“你们想的美，哈克龙，决定是你了。”小智派出了哈克龙。
“双弹瓦斯，看你的了。”小次郎也派出了双弹瓦斯，“用烟幕。”双弹瓦斯惯例的使用烟幕起手。
“超音蝠，你去，把烟幕吹散。”小刚看到烟幕后立刻派出了超音蝠让超音蝠把烟幕吹散。
“哈克龙，使用冲浪。”小智看准时机让哈克龙使用了冲浪，然后就看到哈克龙带着海浪向火箭队那边冲了过去，火箭队变成了落汤鸡，而小锯鳄则是因为有水松开了口，顺着水流来到了这边，君莎小姐立刻上去抱住了小锯鳄。
“可恶，去吧，大食花。”小次郎又派出了大食花，“哎呀，好痛啊，不是我啊。”命苦的小次郎又被吞了，“那边，使用藤鞭。”小次郎从大食花的口里逃脱后下令说。
“去吧，蚊香蝌蚪，玩水。”小智则是派出了蚊香蝌蚪，蚊香蝌蚪身体周围出现了大量的水，不断的被蚊香蝌蚪的尾巴挑起，环绕着蚊香蝌蚪，形成双倍奉还防护罩，大食花的藤鞭只能打散一些水花，但是无法再进一步。
“大舌头，去把小锯鳄给我抢过来。”武藏看到小次郎进攻无效后就派出了大舌头。
“蚊香蝌蚪，连环巴掌。”蚊香蝌蚪的尾巴和大舌头的舌头击打在了一起，互不相让。
“阿柏怪，你去，使用紧束。”武藏派出了最后的宝可梦。
“哈克龙，使用破坏光线。”小智觉得蚊香蝌蚪得到了对战的锻炼后，就打算收尾了，哈克龙直接用出大招，结束了这场训练。
“好讨厌的感觉啊。”火箭队又再一次的飞走了。
事情都结束后，小智他们回到了宝可梦中心，“乔伊小姐，我要参加城都联盟。”小智对着乔伊小姐说道。
“好，现在开始登录参加城都联盟。”小智把图鉴递给了乔伊小姐，而后乔伊小姐把图鉴塞到了一个机器中，然后机器的大屏幕上就出现了小智的头像，乔伊小姐又开始在机器前敲打键盘，在一个进度条读完后，就听到“真新镇的小智，在此正式承认你参加城都联盟大会。”
“好了，这样宝可梦联盟的主电脑就有你的记录在上面了，一切都完成了。”乔伊小姐把图鉴还给小智说道。
“谢谢。”小智收回了图鉴。
“然后这个呢，是指南书，不要搞丢了哦。”乔伊小姐又拿出一本书递了过来。
“当然不会搞丢了，我会好好珍惜的。”不过小刚突然出现把书拿走了，小智也就随他去了。
“只要收集八个以上徽章就可以得到向大会挑战的资格，最靠近这里的道馆是桔梗市的桔梗道馆。”乔伊小姐继续说道。
在告别了空木博士、乔伊小姐和君莎小姐后小智他们就向着桔梗市前进了，新的挑战终于开始了。
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