广美驾驶着潜水艇跟在玛纳霏向着深海行驶着，途中见到了各自稀奇古怪的神奇宝贝，大木博士竟然完全不顾外界的海压就要打开船舱出去，好在小茂等人拼命阻拦了下来。
“啊，我的研究报告。”看着游走的神奇宝贝，大木博士还不甘心道。
“大木博士，你想要研究神奇宝贝也看向场合吧，你想让大家一起在海底同归于尽吗？”小智看着还在挣扎不已的大木博士道。
“可是，好不容易才见到深海神奇宝贝，就要这样错过吗？”大木博士望着游远的神奇宝贝。
“大木，我们这次的计划不能失败，所以你就稍微忍耐一下吧。”咲儿看着大木博士道。
“好吧。”想到这次的目的大木博士不得不放弃自己心爱的研究。
这时，潜水艇突然发生剧烈摇晃
“我们卷入海洋暗流之中了。”广美急忙检查仪器上的各项数据，有些慌乱道。
“小智。”花子喊了小智一声。
“恩！”小智立刻闭上眼睛，用波导将事情传递给玛纳霏。
“纳~霏”玛纳霏游了过来，用头上的触角怕打着潜水艇的玻璃，接着一只触角指向远方。
“玛纳霏说不用担心，跟在她身后就行了。”小智对着广美道。
在卷进暗流的情况下面想要操控潜水艇继续前进可不是什么简单的事情呢，好在广美非常熟练的在仪器表上按了几下，潜艇总算调转过来，跟在玛纳霏身后，这时海中的暗流进一步加大，潜水艇的摇晃动作也越来越大了，大家在潜艇中抓住扶手，好不容易撑了过去。随着暗流渐渐平息，潜水艇的摇晃也停下来了！
“太好了，看起来我们安全了呢！”广美松了一口气道，而玛纳霏也在窗户外开心的叫了几声！
广美继续操纵潜艇跟着玛纳霏前进着，突然，玛纳霏就好像是进入了黑洞一样，消失不见了，就在众人疑惑之际，潜艇也好像进入另一个空间当中，仪器表上的各种雷达信号也消失的无影无踪。
紧接着呈现在众人眼前的，竟然是一座异常华丽的宫殿，众人难以置信的看着眼前的一切。
“这就是海之神殿。”小智看着外面华丽的宫殿道。
“好漂亮啊。”瑟蕾娜和芽衣异口同声道。
广美操控着潜艇在宫殿的一个角落靠岸，小智打开舱门伸头出来呼吸了一下，发现竟然有空气，立刻从潜水艇里爬了出来，随后众人也是一样爬了出来。
“真是想不到大海里面居然还有这样子的地方，真是让人感到意外呢，完全都不知道究竟是怎么做的的！”小智看着华丽的宫殿再次惊讶道。
“纳~霏”玛纳霏也是从水底跳出来落入小智的怀里高兴的叫道。（到家了。）
“是啊，到家了。”小智看着怀里的玛纳霏小声道。
“纳~霏”玛纳霏疑惑的看着小智。（怎么了。）
“没什么，到家了应该开心才对啊。”小智将玛纳霏抱紧，看向了宫殿上方。
“我们走吧，小智，要送玛纳霏回家了。”瑟蕾娜对着小智道。
“恩。”小智点了点头，抱着玛纳霏向着宫殿里走去。
一路前行至一条走廊上，一道水帘挡住了众人的去路，这时小智怀里的玛纳霏再次哼唱起了歌谣，而随着玛纳霏的歌声，整个神殿也是和玛纳霏的歌声产生了共鸣，紧接着广美脖子上的吊坠也发出绿色的光芒。
广美看了一眼脖子上的吊坠，立刻就明白过来，抬头高兴道：“是来迎接水之民了。”
话音刚落，水帘的两侧缓缓移开，露出后面的走廊，玛纳霏也从小智怀里跳入水中，挥动头上的触角示意众人跟上。
众人跟随着玛纳霏一直走到水路尽头，眼前出现的是一块古老的石碑，众人连忙跑上去查看。
“是海之王冠的印记。”广美认出石碑上雕刻的图案。
“那写着什么呢？”小智抱着玛纳霏问道。
“这个…如果是爷爷的话或许就能够看懂了。”广美端详一会摇了摇头。
“让本大爷来告诉你们吧。”猛然间，另一个声音从身后传来，众人回头一看，竟然是之前的海盗大叔。
“凡顿，你果然贼心不死了。”杰克看着对方咬牙恨道。
“哈哈，那是当然，本大爷开始注定要得到海之王冠的男人！”凡顿大笑道。
“你竟然还敢来，话说你是怎么找的这里的。”小智掏出神奇宝贝球看着海盗大叔道。
“这要多谢你们带我来到这里啊，果然跟在你们身后是正确的决定了。”凡顿看着小智等人大笑道。
“你说什么。”小智不满的看着对方，准备派出喷火龙。
但是小智的动作却被广美拦下了，只听广美很是自信的说道：“这里是水之民的神殿，你是什么也干不了的！”
“我已经调查过水之民的所有事情了，以水之民的证明唤醒在大门后面沉睡的海之王冠，得到了海之王冠之后便能成为真正的海之王者！”凡顿指着石碑上的文字一字一句的说道。
“你…你怎么会！”广美难以置信的看着凡顿道。
“看在你们这些小鬼给本大爷带路的份上，本大爷就让你们见识一下什么是真正的海之王冠吧。”凡顿很是自信的说道，紧接着也是拿出了一串手链一样的东西，那个东西和广美还有脖子上的吊坠貌似一模一样！
“那是水之民的证明，你是怎么得到的。”广美看着凡顿手里熟悉的手链惊讶道。
“要得到它可是废了我不少功夫。”凡顿对此没有做任何的解释，仅仅只是说了这样子的一句话，紧接着，凡顿也是将手链放到了那块石碑的旁边，顿时手链与石板上的王冠开始相互呼应发生蓝色光芒，紧接着，整块石碑也是沉了下去！
等到石碑退到了和地面平齐的高度之后，顶端也是出现了之前那个王冠的图案，紧接着整个王冠也是开始发光了，紧接着一道绿光从地面上闪过，打在了墙壁上面，然后再从下往上在墙上延伸，出现了一个很奇怪的图案！凡顿走上前见图案稍微扭动一下之后，整个墙壁就出现了好几道绿色的光芒，然后就如同分解一样将整个墙壁都给分隔开来了呢，而这个时候，出现在小智等人面前的就是一条畅通无阻的路了！
“哈哈，太棒了！”看到前面畅通无阻之后，凡顿很是得意的大喊了一声，紧接着就跑了进去，小智等人也是赶紧跟上去！跑上了楼梯之后，终于所有人都是看到了这个海之王冠，一个由好几层不明物质组成，上面插着一圈一圈水晶的巨大王冠！
“在这个世界上面有两种人，一种是适合宝物的人，一种是不适合宝物的人，而本大爷就是这个适合宝物的人，适合这个海之王冠的海之王者！”凡顿很是得意的说道，完全无视了身边的小智等人开怀大笑了起来！
“凡顿，你这个家伙想要干什么，难道说你真的想要为了这里的水晶不顾一切了吗！”杰克对着凡顿大喊道。
凡顿没有理会杰克的话，直接是走了过去一把抓住了其中的一根水晶紧接着用力拔了起来，而玛纳霏也是马上赶过去阻止却被凡顿轻易的甩开。
小智连忙抱起玛纳霏，但是玛纳霏却仰天大哭起来。
这时海之王冠的光芒突然消失了，紧接着，原本将水晶包裹着的水全部都开始倾泻了起来，直接将凡顿淋成了落汤鸡，随着水柱的倾泄，大厅其他洞口也开始源源不断的有水倾泻下来。
“海之神殿要塌了，凡顿快点把水晶插上去。”杰克看着洞口倾泻下的水柱对着凡顿大吼道。
“这些东西早就已经是本大爷的东西了，怎么可能还回去。”凡顿不为所动的继续拔着水晶，根本没有理会杰克。
“这家伙已经疯了，不能让他继续下去了，既然这样只能由我亲自动手了。”杰克快速的冲向凡顿，抓住凡顿背包里的两根水晶快速的插回原位。
“该死的家伙，快点把本大爷的水晶给放下来！”凡顿大喊着追了上去，但是杰奇明显有练过，总是在千钧一发之际躲开，被插回原位的水晶越来越多。
“被本大爷得手了。”就在杰克准备插回最后一枚水晶时，一时失手被凡顿抱住了，凡顿得意的笑道。
“白痴，这样子下去海之神殿可是要沉没的，难道说这样你都无所谓吗？”杰奇不甘心的说道！
“这种事怎么可能。”凡顿对于杰奇的话直接选择了无视，紧接着猛的一把力，手拿着水晶竟然将杰奇给举了起来！
这时一道水柱对着两人打了下来，杰克手里的最后一枚水晶也是掉了下去。
“糟了…”看着水晶掉落下去，小智将玛纳霏交给瑟蕾娜，转身跳入水中，但是水晶早就不知被冲到什么地方去了。
这时一股暗流卷来，直接将小智卷入通道里面。
“小智…”看到小智被暗流卷走，瑟蕾娜抱着玛纳霏惊呼道。
“不行了，神殿要塌了，我们要赶快回到潜艇上去才行。”广美看着积水越来越多转身对着众人道。
“可是小智…”瑟蕾娜担忧道。
“小智不会有事的，我们走。”咲儿拉着瑟蕾娜往潜艇方向跑去，众人也紧随其后。
暗流里，小智还在苦苦挣扎，这时一道巨浪打来，小智直接被打昏沉了下去。
“唉…”海底不知从何处传来一声悠扬的叹息。
等到众人赶到潜艇处时，整个神殿大部分都已经是被海水给淹没了，众人连忙乘上潜艇，这时一道水柱垂直打落下来，潜艇直接漂离了神殿。
“小智！”瑟蕾娜看着窗外沉没的海之神殿大吼道。
“纳~霏”这时玛纳霏一根触角指向瑟蕾娜额头，一根触角放在潜艇的玻璃上，一道粉色的光芒在水底传递着。
“这是？心电感应…小智不要放弃，我相信你一定可以做到的。”瑟蕾娜惊讶的看着眼前的一幕，连忙闭上眼睛双手祈祷的放在胸前默念道。
这时神殿水底的小智感应到瑟蕾娜的心声苏醒过来，却发现一道淡蓝色的光芒包住了自己，自己在水中竟然可以自由呼吸，而且最后一个水晶竟然就落在自己身边，小智连忙抓住身边的水晶往神殿中心游去，并将水晶插进了最后空洞之内。
随着最后水晶的归位，海之王冠也是开始放出了黄色光芒，紧接着这个光芒也是越来越强烈，小智在强烈的光芒下面也是连双眼都没有办法睁开来，只得闭上了双眼。
接着原本即将沉没的海之神殿也不在继续下沉，神殿内的海水也被快速的排放出去，海中突然出现大量的水系神奇宝贝，纷纷游向海之神殿，随之海水的排出，海之神殿也渐渐上浮至水面，没过多久，整个海之神殿都是出现在了大海之上，神殿周围的透明光罩也随之消失。
潜艇也马上上浮停靠在海之神殿旁边，瑟蕾娜连忙打开舱门抱着玛纳霏往神殿中心跑去，这时一道黑影突然出现在瑟蕾娜身边，抢回瑟蕾娜怀里的玛纳霏后立马快速的离开，瑟蕾娜这时才看清黑影的真面目，原来是凡顿，神殿沉没的时候，他找到了一个密封罐，躲过一劫。
“玛纳霏！”瑟蕾娜看着被抢走的玛纳霏惊慌道。
“只要有这家伙在的话，随时都可以知道神殿的位置了！”凡顿抱着玛纳霏驱使着快艇往自己的巨型潜艇开去，等到众人想要追击之时，凡顿已经驱使着快艇远离神殿了。
这时神殿中心飞去一道金黄色光芒追赶凡顿的快艇而去，凡顿连忙改变方向，但是光柱还是紧追不舍。
“那个是…”瑟蕾娜看着光柱里模糊的人影难以置信道。
“是小智，看样子我们成功了。”大木博士看着咲儿开心道。
“是啊，总算是得到他的承认了。”咲儿也开心道。
凡顿看着在速度上占不到上风，立马驾驶这快艇沉入水中，小智也连忙跟了上去，这时凡顿怀里的玛纳霏大叫了一声，无数的铁炮鱼将凡顿包围了起来，好不容易冲破了铁炮鱼的包围之后，马上就是吼鲸王打飞水面，小智趁机从凡顿手中将玛纳霏夺了过来。
“再见了。”小智抱着玛纳霏转身往海之神殿飞去。
“还没完了。”就在小智以为尘埃落定的时候，凡顿竟然驾驶这巨型潜艇追了上来。
“小鬼，来最后的一决胜负吧，本大爷绝对不会输给你的！”凡顿驾驶着航母很是得意的追赶着小智和玛纳霏道。
“纳~霏”玛纳霏再次驱使水系神奇宝贝撞击凡顿的巨型潜艇，潜艇的数据不断跳动着。
“发射超音波。”凡顿对着手下喊道。
随着超音波的发送，无数的水系神奇宝贝包括在小智怀里的玛纳霏也都受到了超音波的干扰，纷纷混乱的呻吟起来。
“可恶！”小智看着混乱中不停受伤的神奇宝贝，终于忍无可忍的飞跃出水面不满的看着凡顿。
“怎么样，知道本大爷的厉害了吧，我劝你赶快将玛纳霏交出来。”凡顿看着光柱中的小智大笑道。
“凡顿，你太过分了。”小智看着凡顿不满道。
“本大爷想要做的事没有人可以阻止。”凡顿看着小智不屑道。
“水是一切生命的起源，伤害大海的你，必须为你的所作所为付出代价。”小智右手对着凡顿挥下，凡顿立刻改变方向，但是却什么事情都没有发生。
“哈哈…这是怎么回事。”凡顿刚要大笑，潜艇却突然不受控制起来，凡顿好不容易抓稳扶手才没有掉落水面。
“不好了，我们进入旋涡里面了。”手下看着潜艇上的不断跳动的数据惊慌道，这时海面出现八个旋涡将大型潜艇团团围住，潜艇只能无奈的停在中间，水系神奇宝贝们也纷纷恢复过来再次潜入深海之中了，小智则带着玛纳霏飞回了神殿。
“小智！你没事真是太好了。”瑟蕾娜连忙冲过来一把抱住了小智。
“哈哈。”看着众人玩味的眼神，小智不好意思的摸了摸头。
“好了，小鬼看样子你收获不错嘛？”咲儿看着小智道。
“还行吧。”小智看了看双手，再次感觉留着体内的力量笑道。
“看样子，任务完美完成了。”芽衣看了一眼小智怀里的玛纳霏，又看了一看困住漩涡中无法动弹的潜艇伸了个懒腰笑道。
“是呢，看样子要分别了。”小智看了怀里的玛纳霏一眼道。
“纳~霏”玛纳霏看了小智一眼疑惑叫道。（什么。）
“以后你要学着自己照顾自己呢。”小智抚摸着怀里的玛纳霏道。
“纳~霏”玛纳霏惊慌的看着小智叫道。（那妈妈呢…）
“我也有我的路要走，不能永远在一起呢。”小智摇了摇头。
“我不要！”玛纳霏摇头大喊道。
“可是…可是这里…才是…玛纳霏…的…家啊！”小智也抱紧玛纳霏哽咽道。
“纳~霏、纳~霏…”玛纳霏拼命摇头道。（没有妈妈的地方才不是家了，我要毁了他。）
这时海之神殿开始猛烈摇晃起来，原来是玛纳霏命令吼鲸王开始撞击海之神殿起来，而海之神殿的护罩也被玛纳霏撤销了，玛纳霏对这个夺走自己妈妈的地方没有一丝的留恋。
“好了，玛纳霏快停下。”小智连忙叫住玛纳霏。
“纳~霏”玛纳霏却期待的看着小智。（那妈妈不走了吗？）
“这…”小智迟疑道。
“我就知道会变成这样，小智，你把玛纳霏带走吧。”杰克看着还准备继续攻击神殿的玛纳霏无奈道。
“这样可以吗？”小智说不想带走玛纳霏是不可能的，得到杰克的允许，小智难以置信道。
“不然怎么办，眼睁睁的看着玛纳霏把神殿毁掉吗？或许从他在你手上孵化的那一刻，这个结局就已经注定了。”杰克看着小智和玛纳霏道。
“太好了。”小智激动的抱着玛纳霏喊道。
“不过有一天玛纳霏想要回到海之神殿的时候，虽然不太可能啊，但是到那时候小智你必须放手明白吗？”杰克对着小智嘱咐道。
“恩。”小智郑重点头道。
“这么说，玛纳霏要跟我们走吗？”大木博士如梦初醒道。
“是啊。”花子点头道。
“这样真是太棒了。”大木博士激动道。
就这样，小智成功阻止了凡顿的计划，保下了海之神殿，还成为了新一代的海之王者，接下来小智他们又会有怎样的冒险，让我们拭目以待吧。
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