董卓进攻张角不成功，无功而还，便在乙巳日要求皇甫嵩继续北上。
不过，当时张角已经病死，在10月于广宗便和张梁战斗，张梁军犟，于首战不能攻克。
皇甫嵩见状，下令闭营与士兵休息，另一方面派人观察敌军举动。
黄巾军战意稍为松懈，皇甫嵩便乘夜率兵，在黎明时份突袭敌阵，战至下午，成功大破敌军，斩杀张梁及三万多人，于逃走到河堤时溺死的也有五万多人，焚烧车辎三万多辆，虏获人数甚多。
而张角则被破棺戮尸，运首级回京师。11月，皇甫嵩与巨鹿太守郭典攻打下曲阳，成功斩杀张宝，俘虏十多万人。至此，浩浩荡荡的黄巾之乱平息。
起义虽被东汉朝廷镇压，但汉室威信自此遭遇严重打击，然而汉灵帝并未改观，反而继续享乐。
于各地还不断发生小型叛乱，产生许多分散的势力，包括黑山、白波、黄龙、左校、青牛角、五鹿、羝根、李大目、左髭丈八、苦蝤、刘石、平汉、大洪、白绕、司隶、缘城、罗市、雷公、浮云、飞燕、白爵、杨凤、于毒等，势力大的二三万人，势力小的也有六七千人。而由张燕率领的黑山贼，甚至号称从者百万。
中平五年，黄巾余部再度发动起义。
二月，郭泰等于西河白波谷起事，攻略太原郡、河东郡等地。
四月，汝南郡葛陂黄巾军再起，攻没郡县。十月，青州、徐州黄巾贼又起，攻略郡县。
十一月，汉廷派遣鲍鸿进讨声势最大的葛陂黄巾，双方大战于葛陂，鲍鸿军败。
黄巾各部此伏彼起，声势虽然没有第一次黄巾起义般盛，但却令汉室十分头痛。
为了有效镇压起义，于中平五年三月，灵帝接受太常刘焉的建议，将部分刺史改为州牧，由宗室或重臣担任，让其拥有地方军、政之权，以便加强地方政权的实力，更易控制地方，有效进剿黄巾残部。
而正因汉灵帝下放权力，助长地方军拥兵自重，各群雄互相攻击，逐鹿中原，甚至东汉皇帝在军阀手中如同无物，所以黄巾起义是促使东汉灭亡的导火线，也是三国时代的序幕。
东汉末期黄巾大起义，经过了十几年的秘密准备，但起义后仅历经9个月的时间，主力就遭到彻底失败。
黄巾起义的失败原因，无在乎以下几点：
其一，黄巾军面对的敌人强大。起义爆发后，镇压黄巾军不仅有庞大的东汉官军，而且还有各地豪强的大小武装，他们面对的是整个地主阶级的疯狂镇压，最终寡不敌众，终于失败。
其二，由于起义计划被叛徒出卖，使起义不得不仓促发动，各地起义军之间的相互配合发生了极大的困难。尤其是洛阳起义流产，使东汉政府解除了后顾之忧，得以全力镇压外围起义军。
其三，农民起义的历史局限性。从主观方面来说，黄巾军缺乏有战略头脑的军事领袖人物，其起义计划的制定极不完备，起义后各地起义军没有迅速地集结起来，而是分散在各地孤立行动，甚至不进行相互支援配合，终于被官军各个击破。
同时起义军首领缺乏军事指挥才能，张角、张梁、张宝、波才、张曼成、赵弘、韩忠等，个个都是只知固守一城一池，或久围坚城，与东汉军拼消耗，不懂得运用灵活的战术战法，取得主动，始终被动挨打，直至失败。
其四，东汉派来镇压黄巾起义的将领，如皇甫嵩、朱儁、曹操等都是一些能征善战的悍将，他们的统兵作战的能力，军事指挥的才能、战术计谋的运用，都高于黄巾军首领，因而往往能够以少胜多，以弱胜强，最终击败黄巾军。
虽然黄巾起义失败了，但是黄巾起义却对于东汉末年的政局产生了深远的影响。
为了尽快平定战事，中央下放军权至地方，使得黄巾起义的浪潮无法快速蔓延至全国，减缓了东汉覆亡的危机。但是却造成了地方轻视中央，使得具有野心的将领或官员借着在镇压黄巾起义的过程中拥有兵力割据地方，为东汉末年军阀混战揭开了序幕，更为三国分立种下远因。在农民起义的打击下，腐朽的东汉王朝名存实亡，并最终走向了灭亡。
黄巾起义，是我国历史上第三次全国规模的农民革命战争。
比起秦末、西汉末两次起义，这是一次有周密计划、有长期准备、有明确目标的农民起义。
同时，这次起义不再利用某些统治者的旗号，而是公开提出“黄天当立”的口号，表明了农民起义有了新的发展。
这表明，起义更缜密，因为领导人大部分为农民，极大的动摇了顽固派的利益，以杨维旭为代表的富人便支持政府，抗压黄巾军。
黄巾起义和在它影响下的各族人民起义，持续了二十多年。由于起义农民本身的弱点，起义被残酷镇压，但在农民起义的打击下，腐朽的东汉王朝已名存实亡。
看着手中的情报，姜昆仑忍不住一阵唏嘘，这才多长时间时间黄巾起义就玩完了？还没半年吧，大名鼎鼎的张角就这么挂了？
不过这也代表着乱世的开始，不就的将来汉灵帝就要挂了，然后十常侍乱政，搞死了大将军何进，再然后董卓就要进京了。
董卓一旦进京，就代表决战即将到来，到时候姜昆仑就可以会会这天下英雄了。
看着自己身边的乞活军，姜昆仑心中升起了无尽豪气，这些都是自己的资本，和天下为敌的资本。
趁着还有三四年的时间，姜昆仑准备彻底肃清草原，将五胡乱华的历史惨局从萌芽上灭杀掉。
自己来这里不能屠杀汉人，那就拿你们这些胡人开刀好了，为了不在发生五胡乱华的历史悲剧，就请你们全部去死吧！
“来人，想着匈奴王庭进军，开始最后的肃清行动！”姜昆仑骑在朱龙马上，杀意凌然的说道。
“诺！”姜昆仑身后的乞活军齐声道。然后，跟在姜昆仑的身后奔腾远去……
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