这天朱由检宣布摆驾文渊阁，召集六部阁卿商议这件大事，同时命人将京营的提督陆皓天也唤了过去。
皇上突然召集六部阁卿商议大事，这让大臣们都吓了一跳，还以为发生了重大之事呢，还不急急忙忙的往文渊阁赶来。
“朕突然召大家来，是为了一件很重要的事情，关系到我大明朝长治久安，国祚永长的大事。”
朱由检看自己要求前来的人一个不少的都到了，命人关上会议室的大门，很郑重的开口道。
“朕决定设立军机阁，废除五大都督府，全国兵事将由军机阁全权处置，兵部从此将直接由军机阁节制。”
从此文不掌兵，武不干政，至于废除五军都督府，更重要的一点，是朱由检要把军权全部抓到他的手里来。
这个决定一经宣布，会议室中原本还因为匆忙赶过来气喘吁吁地声音顿时就听不见了，那是一阵短暂的寂静无声，各人的脑袋中都在飞快的运转着，他们有的在想皇帝此举仅仅是自己抓兵权呢？还是有其他什么目的？
“微臣敢问皇上。军机阁与内阁是谁领导谁呢？”刑部尚书杨鹤站起来问道。
“军机阁是独立地，内阁无权过问军机阁的军务，同样军机阁呀无权过问内阁政务。”朱由检道。
“微臣请问皇上，军机阁大臣都由哪些人组成？”礼部尚书黄尊素问道。
“军机阁不设首辅大学士，直接对朕负责，暂设军机副相一名，军机大臣八名。这个具体待定。”朱由检想了一下回答道
“军机阁成了之后，各部凡是涉及军事方面的包括一系列官员和事务全部移交军机阁，像工部的各种兵器，铠甲、军服的制造等等。”
这下所有的官员都明白了，这军机阁是要独立成一个系统了，以后的六部恐怕要改成五部了。这不仅仅是一场改革了。而是大明朝文武彻底地要分家了，所带来的影响根本无法估量。
听着皇帝的这些话之后。在场许多人官员脸上都露出凝重之色，弄不好，这是要天地变色的。
皇上设立军机阁的真正的用意，原来居然是彻底的实行军政分开，文官只有管理政务地权力，而军权却牢牢地被皇上抓在手里，国家以后等于皇帝想怎么干就怎么干了，这岂是文官士大夫阶层所能容忍的吗？
他们拼命的想削弱皇权，到头来皇权还是被巩固到了皇帝手里，他们岂有不反对之理？
“皇上，万万不可，万万不可呀！”老臣韩爌出言反对道，在座地大臣中就属他的资格最老，也就他敢说出这样的话来。
韩爌这些老臣，属于东林一脉的，这些人的政治意图，就是以他们的想法来改造这个大明朝，如果把权力都集中到了皇帝手里，那他们岂不真的成了提线的木偶，任由皇帝摆布吗？
“韩老爱卿，你倒是给朕说说，为什么不可吗？”
朱由检想透了这一点，心中未免不悦，现在这个时候只有把权力集中在他一个人身上，才能带腐朽的大明朝走出困境，你们要限制和分出君主的权力也不应该是在这个时候！
“启禀皇上，老臣认为皇上的用意是好的，但……”
韩爌不愧是饱学之士，一通话是口若悬河，滔滔不绝，说的在做的几位大臣都深表赞同，纷纷谏言支持。
朱由检听了之后，先是愤怒，后渐渐平复情绪，慢慢的冷静下来，自己的想法虽然好，但明显忽略了一点，就是明朝的内阁制，已经大大的削弱了皇帝的权力，封建顽固士大夫的力量不容小视。
“朕刚才思考了许久，认为韩老大人的意见很是中肯，朕决定采纳他的建议，军机阁的设立只是代替了原来的五大都督府的职权，合五为一。”
“同时赋予它在朝廷内外军机上的决策之权，原本五军都督府就归兵部统一管辖，现在朕也这么做，原内阁首辅大学士兵部尚书孙承宗改任军机阁军机副相，他的内阁首辅大学士的职务暂有韩爌韩老大人担任，你们看如何？”
朱由检不得已只得转过弯来道。
韩爌等人见皇帝从善如流，内阁首辅大学士的位置也到手了。自然大呼“皇上圣明”，决议就这么通过了，东林党又一次抬起头来，尤其是韩爌的学生李标任吏。
既然直接撕不开这张士大夫势力之网，还有那帮子自以为是的东林党人，看来要实行拉拢、分化的办法了。
还要让官员年轻化，他们更加容易接受新事物，新的思想。
大学这块阵地地的争夺必将掀起一场没有硝烟的战争，千万不能让东林党把这块至关重要的阵地也抢了过去，如有必要以结党的罪名将这些人清洗了。
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