跟着收服皮卡丘的特殊球，小智进入新岛的宝可梦复制实验室。
在这里所有被特殊精灵球抓走的宝可梦，都被机器采集DNA，然后复制出克隆体。
在这里特别厉害的是，为了拯救皮卡丘，小智直接跳入机械内，被各种机械触手围攻。情急之下小智还用嘴咬断了机械触手。
赤从来只觉得小智的臂力惊人，能单手抱起重达72KG的由基拉，没想到小智的牙力也是那么的惊人，连金属都能咬烂。
难道这就是传说中的牙好，吃嘛嘛香，身体棒，所以臂力才那么厉害的吗？还以为是跟着动画播放，单身十多年才练出来的。
还有这是什么垃圾复制机器，只是部分机械触手被破坏，能影响到整部机器都全部都被破坏。
实验室遭到破坏后，复制体宝可梦们开始逃离实验室，本体的宝可梦们也在小英雄小智带领下逃出实验室。
逃出实验室后小智做的第一件事，是冲过去想给超梦一发友情破颜拳。
亲眼看到小智对着超梦冲过去，赤真的忍不住吐槽，小智你以为自己是上条大妈？以为你的右手寄宿着幻象杀手，能把超梦的超能力消除然后揍它一顿？
如果不是梦幻帮忙，小智已经嗝屁了，哪里还有以后的十年动画。
“梦幻跟我谁强，本体的你们和复制的我们，谁更强？”
于是第一届无技能，宝可梦肉搏大赛开启，尤其是皮卡丘被殴打的那一幕，截图表情用途可是非常广泛。
其实宝可梦们为什么要互相伤害，殴打火箭队不好吗？
梦幻和超梦的战斗进入到白热化的时候，正体和复制体宝可梦们都已经累得无法动弹，相亲相爱的依偎在一起，印证了不打不相识这句古话。
见识到正体和复制体的战斗，小智下定决心要阻止超梦和梦幻的战斗，不过赤也搞不明白，为什么小智非要选双方发动攻击的时候介入，而且还要跑到梦幻和超梦的攻击正中。
被击中后的小智变成石头，不过也在本体和复制体的眼泪下浮生。
正是因为小智的舍己为人，让超梦终于认识到。
尽管我们是被复制出来的，但我们都是宝可梦。
终于认识到这点的超梦，准备带领复制体宝可梦们离开。
小智：“你们要去什么地方？”
“去找一个属于我们的世界，延续我们的生命”
赤：“那么我有个建议，要不要到我的地盘去。”
超梦：“你的地盘？你是谁。”
赤才想起为了掩饰自己的身份，还一直带着面具，赶紧把面具脱下来。
“是你，联盟冠军赤。”
“是你，当初在常磐道馆打败我的小鬼。”
“是我，你也知道我是宝可梦训练师，我在真新镇买下了一大片的原生态土地作，为我的宝可梦的栖息地。除了我的宝可梦和负责照顾宝可梦的人，没有其他外人踏入。”
“小智，你们真新镇的地价大概多少啊？”
“我也不是很清楚，我就记得当时有宝可梦联盟来到我们真新镇，想要在这里建立一个道馆，但是后来因为地价太高，只能放弃。”
“不是吧，连宝可梦联盟都建不起道馆的地方，赤拥有大片的原生态土地，他家里是开煤矿的吗？”
——
把大木博士的研究所大致地址告诉超梦和梦幻之后，它们一起使用瞬间移动，带着赤和小黄回到真新镇。
赤带着超梦绕了自己的地盘一圈，超梦还是对这里的环境非常满意。
“哪里来的小偷，去吧喷火龙。”
突然传来大木博士的声音，应该是看到人大半夜鬼鬼祟祟的出现在研究所里，大木博士把自己当做是小偷了。
“阿布，念力。大木博士，是我。”
听到阿布的名字，还有自己的老伙计喷火龙轻易被制服，大木博士知道是如假包换的赤。
“是赤啊，你怎么没有提前打招呼就回来了，我还以为是哪里来的小偷。”
这时天上的乌云逐渐散去，皎白的月光映在赤背后超梦和梦幻的身上。
见多识广的大木博士马上认出梦幻，激动地开始语无伦次。
“人类，为什么这里会有这种穿白大褂的，你是想和创造我的那些人一样吗？”
超梦明显有点不悦，手中开始蓄力着技能。
“嘛嘛，就算是博士也分很多种，这个叫大木博士，负责帮忙照顾我的宝可梦的，只是偶尔会对宝可梦进行研究，也不会对你们产生什么影响。”
和超梦大致解释了大木博士后，赤也像大木博士对超梦还有后续的事情进行了简单的介绍。
接下来的时间就是超梦和博士的谈判，赤无聊的假装四处看风景。
“啊咧，什么时候我的地盘多了那么多绿毛虫，居然还有粉色的绿毛虫。”
“那是你的粉色巴大蝴，经常吸引很多巴大蝴过来，于是你的领地绿毛虫越来越多，不过经常其他研究所的人过来购买，所以资金和数目方面绝对不用担心。”
超梦和博士约法三章之后，博士满足的和赤解释。
“不过很奇怪的是，你的巴大蝴第一代的绿毛虫都是普通的绿毛虫，但是从第二代开始才开始产生粉色，我们一直在研究是什么愿意。”
“第二代粉色的正常颜色比值大概是1:3吗？”
“赤你怎么知道的。”
赤：好吧，看来这个世界孟德尔遗传定律，异世界不仅宝可梦知识太落后，连生物学知识都那么落后，那是点了什么科技点制造出超梦的。
再次简单的把孟德尔遗传定律和大木博士解释后，超梦准备带着赤他们回到新岛。
“超梦和梦幻，走之前不来一个友情的收服吗？”
最后超梦和梦幻带着赤回到新岛，发动魔法把时间回流至大家在码头的时候。
小智：“奇怪，我们为什么会在这里？”
赤：“我们不是来这里准备乘船到橘子群岛吗？”
小智：“哦好像是这样的。”
赤：还是小智好骗。
带着梦幻和超梦名字前有个精灵球图标的图鉴，赤心满意足的踏上前往橘子群岛的渡轮。
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