那女娲娘娘将伏羲琴带到了娲皇宫，手上红光一闪，在自爆中被其护住的伏羲真灵便出现在身边，看着伏羲的真灵，女娲不由叹道：“兄长，非是我不愿相救妖族，实是天道使然，我也无能为力，那巫妖二族注定要陨落，人族必将大兴，纵是圣人也不可改变。以后人族将大兴，我便将你送入轮回中到人族转世重修，至于兄长的灵宝小妹我也会在合适的时候还给兄长的。”
说完便将伏羲的真灵卷入袖中向轮回地狱飞去，伏羲此时却是在想自己先前卜算的一卦，“难道我的机缘就在人族？”
片刻后女娲便已来到九幽黄泉六道轮回前，将伏羲真灵放出后，道：“兄长，小妹我这就将兄长送入人族轮回中。”说完便将伏羲的真灵送入代表人族的轮回通道之中，而后便返回娲皇宫。
悠悠千年时间，伏羲真灵转世，借助河图洛书创出了伏羲八卦，证得了人族天皇之位，之后神农尝百草，编著出《神农百草经》，成就了人族地皇之位，一直到如今轩辕氏继位，成为人族新一代的共主。
此时人族部落遍布洪荒大地，真正成为了洪荒最大的种族，在众多的部落中，有一部落名为九黎，其族人大多是都是当初巫族和人族结合的后代，继承了巫族强大的肉身还有人族修炼的资质，天生体格强壮，能征善战，部落之中有一人名为蚩尤，乃是九黎部落中的第一高手，也是新当选的族长。
在连年与大地上的野兽厮杀中，蚩尤竟然觉醒了前世的记忆，原来蚩尤本就是跟随祖巫攻上天庭的大巫之一，在鸿蒙紫光混沌神雷下本该形神俱灭，只是终究让他寻得一线生机，真灵遁入了六道轮回中。
蚩尤觉醒前世记忆，恢复大巫身份后，想到巫族往日的荣光，不愿看到巫族被弱小的人族统治就此落寞，便开始行走洪荒，寻找那些觉醒了巫族血脉和那些在大劫中依旧幸存的族人，一时间，还真被他找到了不少，特别是取得了看守祖巫殿刑天大巫和九凤等大巫的支持，他想到一旦被人知道自己大巫的身份，定会受到道门的打击，于是便想到借助人族的气运重振巫族，于是利用开始改头换面地传授给族人一些粗浅的巫法用来改善体质、强化肉身，并且依靠自己的智慧发明了弓箭、金属武器等，准备以此与轩辕争夺天下，此乃人族内战，蚩尤相信圣人及其门人也不会轻易出手对付自己。
蚩尤带着九黎部落族人开始四处征战，不断吞并一些周围的小部落加强自己的实力，一日他在击杀了一只地仙级别的妖兽后，寻到它的藏身之处时竟意外发现了一种奇特的金属，能够吸收天地间的煞气怨气，当积累到一定程度时还拥有神鬼莫测的威能，蚩尤得此十分高兴，将此发现告诉了刑天九凤两人。
九凤乃是当初布置十二都天神煞大阵的第十二人，对此大阵的原理还有阵图十分熟悉，此时听闻蚩尤说起这种奇异金属，心中一动，开口说道：“蚩尤，我等可以利用这种金属打造十二祖巫之像，让其凝聚无边煞气怨气，再融入我等大巫的精血，便能够布置出伪十二都天神煞大阵，到时轩辕等人定然不是对手，蚩尤你便可以取而代之，成为人族共主，借其气运振兴我巫族。”
“好啊，果然是天不绝我巫族，可是如何收集这煞气和怨气？”蚩尤闻言大喜，不过又有了另一个问题。
“这还不简单，人族遍地都是，妖兽仔细找找也简单，他们就是怨气与煞气最好的来源，正好九黎部落还不够强大，趁此机会攻打其他部落，壮大实力。”刑天毫不在意地说道，对人族和妖族余孽妖兽没有丝毫的好感，话中可谓是杀机尽显。
“好，我这就去办。”蚩尤一听也觉得十分有理，三人又商量了一些具体细节后，便各自离开。
此时又正好因为神农之子对轩辕多有不服，竟然叛变了，而且洪荒中还有不少部落支持他，此时轩辕正御驾亲征。
蚩尤看准时机，打着帮助轩辕的口号，开始攻打那些叛变的部落，九黎部落原本就实力雄厚，加之又修有巫法，可谓是连战连捷，等待轩辕平息了叛变时，那九黎部落竟然已经壮大到了仅次于轩辕部落的实力，而蚩尤亲自铸造的祖巫像也收集了足够的煞气怨气，并且融入到了刑天九凤和自己的大巫精血，可谓拥有了与轩辕一战的实力，两人之间的大战是一触即发。
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