兹乙风事件后，世界又恢复了和平，阪神大学的中谷教授在约翰斯顿环礁岛发现了传说活了一亿年的古代怪兽哥莫拉，想把其作为展览品放在东瀛世博会于是联系地球防卫军，特搜队接到这件事之后，也去了约翰顿环礁岛。
很快，地球防卫军大军出动，埋伏在了山洞前，过了不久后，哥莫拉从山洞里爬了出来。
村松和岚用UNG麻醉弹，打中了哥莫拉的两只肩膀，哥莫拉顿时感觉头晕，然后趴在地上睡着了。
之后，特搜队用三架威托机将哥莫拉空运到大阪，然而，麻醉弹在空中，因为受到气温的影响而提前失效，哥莫拉醒过来后，开始挣扎了起来，然后，三架威托机只好把网断掉，哥莫拉从两万米的高空坠落到了地面。
就在所有人以为哥莫拉必死无疑的时候，哥莫拉竟然苏醒了过来，而且还获得了强大的力量，防卫军立刻展开攻击，坦克的大炮直接轰炸，但是却没有作用，哥莫拉一个大脚，踩烂了坦克，接着，哥莫拉潜入了地下离开了。
此时，萧宇若家里，萧宇若收到了哥莫拉的消息。
司徒成说道：“哥莫拉啊，听说是个很厉害的怪兽。”
赛罗说道：“是啊，哥莫拉在雷蒙的手里，是跟我们一起作战的伙伴。”
萧宇若：“而且在大地他们那里，大地一直想和哥莫拉一起生活，算来算去，哥莫拉也不算太坏。”
南宫星问道：“如果哥莫拉被酷卡雷伏斯抢走了，那该怎么办。”
李梦可说：“我好像，听说过哥莫拉，好像很厉害，要是落在那家伙手里，估计也是个麻烦。”
萧宇若：“哥莫拉确实是个很厉害的强敌，它可是能够打倒初代的怪兽，力量可是很强的，这次估计要有的忙了，走，我们去看看，这次打哥莫拉应该会很有趣，我们出发。”说完几人就开始去了。
另一边，在某座山上，黑袍人正在看着远处，喃喃自语的说道：“哥莫拉可是个很厉害的家伙，最少可比雷德王要厉害多了，把它收了，就离我的计划要成功一大步了，那些古阿军团的笨蛋真是够白痴的，仅仅凭借他们手底下的部队，以为就能打倒所有的奥特曼了，根本就不知道多招集有用的人才来壮大自己的队伍，简直可笑。”
“不过，这样收集怪兽实在是太慢了，不行，我得找点帮手，对了，就让莫尔德还有吉娜来吧。”说完黑袍人化作一团黑雾就离开了。
另一边，哥莫拉来到了大阪的一个空地，钻出地面后开始疯狂的破坏。
早田连忙变身为奥特曼和哥莫拉对战，但是，哥莫拉用其强大的力量让奥特曼无法靠近，甚至压制了奥特曼，奥特曼无法使用任何光线，然后，哥莫拉使用尾巴抽打着奥特曼，强大的尾巴让奥特曼无法爬起来，奥特曼痛苦的躺在地上，而不知道怎么的，贝塔魔棒居然从奥特曼的身上掉落，落到了一个小孩子的面前，小孩好奇的捡起了贝塔魔棒。
战场上，打倒了奥特曼后，哥莫拉立刻挖地离开了，奥特曼想用斯派修姆光线，但是却因为身体的疼痛而无法发射，最终让哥莫拉逃走了，奥特曼好不容易站起来，也飞走了，飞走后变回了早田。
另一边的空地上，萧宇若几个人也赶到了现场，但是却没看到奥特曼和哥莫拉。
萧宇若看到前面有个小孩，上前问道：“小孩，奥特曼呢。”
小孩说道：“奥特曼刚才被哥莫拉打败了，对了，这个是从奥特曼身上掉下来的。”小孩举起了手里的贝塔魔棒。
司徒成看着小孩手里的贝塔魔棒，顿时惊了一下，萧宇若说道：“小孩，这个东西能不能交给我们，这个是奥特曼的东西，我们和奥特曼也算是认识的。”
小孩惊奇道：“你们和奥特曼是认识的，那么，你们一定能把这个东西交给奥特曼呢。”
说着小孩把贝塔魔棒交给了萧宇若，萧宇若说道：“放心吧，奥特曼这次虽然失败了，但是他不会一直失败的，下次他一定会成功的。”
小孩点头道：“一定会的。”
而这时，一些家庭主妇来了，其中就有小孩的母亲，岚和伊初也跑了过来。
岚看到萧宇若等人，询问道：“宇若君，你们怎么在这里。”
萧宇若说道：“我们恰好路过这里，听说奥特曼输给了哥莫拉，对了，早田呢。”
岚说道：“早田不知道上哪里去了。”
伊初：“哥莫拉还真厉害啊。”
萧宇若：“哥莫拉拥有非常强大的力量，尾巴的力量也很厉害，要想打败哥莫拉，要先打断哥莫拉的尾巴，那条尾巴很厉害，即使是断了也还能活动。”
伊初：“那我们下次就先打断哥莫拉的尾巴。”
岚：“我们先去和队长汇合吧，哥莫拉可能随时都会出现的。”
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