人类补完计划是新世纪福音战士(EVA)中比较重要的一部分，可以说EVA整个故事都是围绕着人类补完计划进行的。
人类补完计划是该片中隐藏比较深不太容易理解的概念之一。因为《新世纪福音战士》一共有所谓的“两个结局”其一是动画片TV版的第25、26话，以意识流式的心理分析中结束。另一个就是在电影版TheendofEvangelion中描述的第三次冲击的发生为结局。关于这两种结局，讨论相当激烈，各人各持己见，并没有一个确切的结果。
关于“人类补完计划”及其内容，一直是“EVA”研究者们争论的焦点，因为这个“计划”是整个故事的基础环节。然而，在动画片中却始终没有给出明确的答案。比较通行的观点是：人类（无论是肉体还是心灵）都是由脆弱的物质构成的，所以也就非常容易受到伤害，而在人与人之间，心灵的世界是彼此隔绝的，要使人类向更高的领域进化，就必须使人的心灵摆脱躯体的束缚，重新回到人类的诞生之地“莉莉丝之卵”中。唯有如此，才能最终拆除人与人之间的心灵屏障，使不同的心灵世界能够相互补充，走向进化的终点——成为永生的“神”。人类补完计划就是为了实现这个神圣目的而创立的。
另一种观点认为：《圣经》中记述了伊甸园里有着被称为“智慧之树”和“生命之树”的树木。因为受到化身为蛇的魅惑天使的诱惑，亚当和夏娃偷吃了被视为禁忌的“智慧之果”，从而拥有了神才有的智慧和“羞耻之心”。神害怕他们再偷吃“生命之果”而获得永生。因此将亚当和夏娃赶出了伊甸园。并命令智天使，手持悬垂之剑，把守伊甸园的大门。“人类补完计划”的最终目的是打败把守大门的天使，取得“生命之果”，使人类得到永恒的生命，所以又有“迈向神之道”计划的别称。
第一种观点可能比较接近于“人类补完计划”的原始含义，而且在动画片中也有很多旁证和引证，也足以支持第一种观点。至于第二种观点可能是根据《圣经》与故事的联想，与动画片内容似乎没有直接的联系。
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