路飞决定将新船命名为桑尼号。桑尼号使用了特制的紧急加速装置[风来爆破]跃向天空，成功地摆脱了卡普的追击，顺利地离开了七水之都。此时，路飞的故乡风车村，这个海贼团的第一个成员的出身地，他的悬赏令成了众人讨论的话题。大家都以自己的故乡能出现一位闻名于世的海贼而欢快不已。另一方面，升为准将的斯摩格听闻了路飞一伙人的消息后，赌上了海军的尊严，发誓要擒拿路飞一伙人。
桑尼号出航一段时间后，路飞他们终于来到了到鱼人岛之前必须经历的魔鬼三角地带，可可罗婆婆也曾经警告他们这里会出现神秘的鬼怪，乌索普、乔巴、娜美十分害怕，不料真的出现了一个笑声怪异又会说话，行动自如的骷髅人。路飞看到骷髅人布鲁克兴奋的不得了，因为他觉得会动会说话又爱说笑的骷髅人太有趣了，于是邀请他加入他们，并且带他回船上享用美味晚餐。布鲁克开始娓娓道出他成为骷髅人的原因。在布鲁克加入路飞他们之后，很快地就遇到了传说中在海上徘徊的幽灵岛恐怖三桅帆船，布鲁克要他们立刻逃离这个地方随后就消失无踪，接着发生了接二连三的怪事，首先是坐着迷你梅利号的娜美三人失踪，再来是似乎有人上路飞他们的船整他们。
乌索普,乔巴和娜美三人被希尔顿载往霍古巴克医生宅邸，不料他们在半途中看到外面可怕的景象要希尔顿送他们回原来的地方，希尔顿下车后却一去不回连马都不见了，被丢在墓园中的娜美他们只好下车结果就遭遇到一堆僵尸。除了娜美他们之外，路飞和其他人也上了这座岛，不过虽然遭遇到同样的怪生物，路飞他们的态度却完全不同，不但不害怕还主动出击，娜美他们则是在霍古巴克宅邸里，感受到处都是僵尸的可怕气氛。娜美他们好不容易逃过画像僵尸的追捕,躲进了一个房间里，这里的墙上挂满了很像是辛德莉的女孩的照片，可是看到一旁的报导又好像不是同一个人，接下来他们误打误撞来到霍古巴克医生的研究所，看到了惊人的事实。娜美三个人无意间闯进了霍古巴克的研究所,更惨的是竟然被发现了，另一组人马路飞等人则是在解决掉僵尸们之后，遇到一个和布鲁克一样没有影子受重伤的老人，老人说出了这一切的幕后指使者就是王下七武海之一的月光·莫利亚。路飞他们终于也来到了僵尸鬼屋，他们一心想要尽快找到娜美他们，不料在经过一阵打斗之后连山治都不见了，墙上的猪噗查克则是被他们打下来要帮忙带路，而被霍古巴克发现的娜美他们则是被武士龙马的剑砍中不支倒地。被龙马砍昏的娜美他们,原本要被佩罗娜的手下送到主人那边,没想到在一个长长的走廊上掉出来,不过,他们的恶运并没有就此结束,因为在佩罗娜不可思议的庭院中,有更多稀奇古怪的动物僵尸在等着他们。原本在中庭被动物僵尸包围的娜美三人，竟然有一只狗企鹅挺身而出保护娜美，而且坚持不踢女人的信念和满口爱的蠢话，让人不得不联想到山治，不过更可怕的敌人接着出现那就是一心想娶娜美为妻的阿布萨罗姆，还有紧追在阿布萨罗姆之后的野猪僵尸罗拉。
路飞被抓走之后第一个被送到莫利亚面前，于是莫利亚要求三怪人回去找他，至于被罗拉追杀的娜美则是在机智下逃过一劫，和乌索普及乔巴暂时安全，而弗兰奇和妮可·罗宾则是在塔拉拉及他的蜘蛛老鼠军团围攻下陷入苦战，这时突然有个号称剑侠鼻歌的骷髅出现了。布鲁克的及时出现，解救了弗兰奇和罗宾的危机，而且他又解释了这座岛上的所有疑云，而被抓走的路飞即将面对被夺走影子，再造成僵尸的命运。虽然娜美、乔巴及乌索普三个人将一切看在眼里却不敢出声救路飞。路飞被莫利亚抓到之后，马上就要进行剪掉影子再注入强壮的尸体体内，然后成为听令于莫利亚的部下，莫利亚和霍古巴克就是利用这样的方式制造出许许多多力量强大的僵尸，幸好在布鲁克的提醒下弗兰奇和妮可罗宾要赶回船上救伙伴。路飞的影子被剪走，变成魔人奥兹复活了！亲眼目睹这件事发生经过的娜美、乌索普跟乔巴，急忙想赶回桑尼号解救同样被剪走影子的索隆跟山治，并且告诉他们这件惊人的事实，可是，却在途中被变成透明人的阿布萨罗姆埋伏，让娜美被掳走了！就在乌索普与乔巴差点被僵尸大军击溃的时候，莫诺、罗宾和弗兰奇及时出现救了他们。
本来以为塞进路飞的影子而复活的僵尸奥兹，会听从莫利亚的话，变成世界第一大坏蛋，没想到奥兹只是变得跟路飞一样，不停地大吃大喝，还破坏了囚禁他的特殊冷冻室跑到外面去，甚至说出了我要成为海贼王这样的话！另一方面，为了夺回自己的影子，鼻歌布鲁克又再次对剑豪龙马提出决斗的要求！
妮可罗宾和弗兰奇适时出现解救了乌索普、乔巴的危机，四个人连忙赶回桑尼号上要叫醒路飞、索隆及山治等三个影子被夺走的人，以免他们照射到太阳而灰飞烟灭。而莫诺则选择去找布鲁克。
大致瞭解发生什么事之后，路飞等人决定要再次攻进莫利亚的城堡，就回所有的人以及船上的粮食。在出发之前，弗兰奇向众人说出之前他从布鲁克那里问到的关于布鲁克的过去，原来，布鲁克一直想再见一面的朋友，竟然是一只鲸鱼！
听到弗兰奇说出的关于布鲁克的惊人过去，路飞等人才知道，原来宁愿变成骷髅、不能照射到太阳，用这种不死不活的姿态也要活下去的布鲁克，一直想再见一面的朋友，就是路飞他们刚到伟大的航道，在红土大陆的双子岬碰到的鲸鱼拉布！感动于布鲁克跟拉布不知间坚定的友情，路飞他们决定也要帮布鲁克抢回他的影子！
要抢回被夺走的影子最好的办法就是直接打倒月光·莫利亚，得到这点结论之后，路飞、乔巴跟妮可·罗宾决定直捣黄龙，找莫利亚算帐。山治当然是要去阻止阿布萨罗姆迎娶娜美，乌索普觉得娜美是在自己眼前被带走的，所以他也有责任要去救回娜美。弗兰奇担心布鲁克和莫诺的情况、索隆想会会剑豪龙马，因此两人一起朝着布鲁克和龙马的决斗战场前进，草帽海贼团等人各自朝着自己的目标分头行动！
一起行动的路飞、妮可·罗宾和乔巴在冷冻室前的大厅碰上霍古巴克的阻挠，乔巴和罗宾联手阻止辛德莉的攻击，让路飞顺利闯入冷冻室中。因为行医理念的不同，乔巴和霍古巴克展开了生死对决！另一方面，在弗兰奇的帮助下，乌索普、索隆、山治连同弗兰奇等人来到了幽灵公主——佩罗娜的住处，四人因为无法应付佩罗娜消极幽灵的力量而陷入了危机之中！
常常陷入悲观思想的乌索普居然也有派上用场的时候?!索隆等人看准乌索普这一点，将他独自留下来对付佩罗娜，三人继续往各自的目的地前进。山治找上了阿布萨罗姆要救回娜美，索隆跟弗兰奇则在布鲁克差一点被龙马打败之际出手救了他。索隆对龙马手上那把大快刀二十一工之一·黑刀秋水相当有兴趣，甚至发出了要夺下它的豪语！找到月光·莫利亚的路飞努力想要打败他，也得知一个事实，那就是除非莫利亚亲口说出要影子们回到主人身边，否则就算杀了莫利亚也没有用。与此同时，乌索普跟佩罗娜陷入了你追我跑的混乱之中。还没完全被控制住的魔人奥兹更是在船上大闹特闹了起来，跟是和伤还没痊愈的莫诺打了起来。
一心一意要救回娜美的山治闯入了阿布萨罗姆为娜美举行的结婚典礼当中，和阿布萨罗姆展开了娜美争夺战！除了掳走娜美的仇恨之外，山治对阿布萨罗姆还有另外一个仇恨！那就是阿布萨罗姆吃掉了山治从小便一直渴望得到的恶魔果实——透明果实！原来山治从小时候第一次知道恶魔果实的存在开始，就希望能吃下透明果实好到处偷窥，可是因为一种恶魔果实全世界只有一颗，所以看到阿布萨罗姆拥有透明果实的能力，也就代表山治的梦想破碎了。为此，山治对阿布萨罗姆的怒气到达极点爆发了！
乌索普运用自己的超级悲观打倒了佩罗娜的消极幽灵，成功拯救了索隆等人，因而觉得自己比佩罗娜强，开始嚣张地追击佩罗娜，没想到却受到库玛西的阻挠而追丢了她。重新出现的佩罗娜一反一开始的惊慌失措，正面迎敌乌索普，还使出能随意变大变小、自由在空中飞舞的幽灵能力，甚至将手穿透进乌索普的身体里，企图直接用手捏爆乌索普的心脏！就在乌索普陷入万念俱灰的生死关头时，狙击王现身了
在路飞跟月光·莫利亚陷入苦战的同时，妮可·罗宾跟乔巴和拥有索隆、山治影子的治五郎、狗企鹅的战况也呈现胶着状态。而塞入路飞影子后却迟迟没被控制的魔人奥兹似乎也慢慢起了异样的变化……因为狙击王现身而重拾冷静的乌索普终于发现佩罗娜幽灵的真相！原来佩罗娜只是因为灵魂出窍，才能做出那些不可思议的攻击。既然发现了真相，本来快被打败的乌索普最终扭转了战况！
为了会会传说中的剑士，索隆跟着弗兰奇来到布鲁克和龙马决斗的地方。以剑术闻名的两位大剑豪展开了一场惊天动地的决斗！因为奥兹在船上大闹的关系，所有的将军僵尸都出动猎捕奥兹，可是没想到奥兹的力量竟远超过众人的想像，一下子就将为数众多的将军僵尸消灭殆尽，还让莫诺陷入了绝境。就在众人拿乱闹的奥兹没辄之际，奥兹的神智似乎渐渐被月光·莫利亚控制了。
看到传说中的名医霍古巴克居然是个将生命视为玩物的大坏蛋，曾经很崇拜他的乔巴怎么样都没办法原谅这种行为。霍古巴克欣赏乔巴的医术，因此一直极力说服乔巴加入月光·莫利亚的行列，最后甚至说出辛德莉的秘密！原来辛德莉生前是世界知名的女演员，不但长得漂亮，为人也相当温柔。但是就在因为意外过世之后，霍古巴克竟然为了一己之私将辛德莉变成了完全服从命令的僵尸！知道真相之后，乔巴燃起了熊熊的怒火！乔巴发自灵魂的呐喊，奇迹似的唤醒了应该已经不存在的辛德莉身为人类的情感！因为辛德莉的反抗，让乔巴和妮可·罗宾有机可乘，两人联手打败了霍古巴克。这时，拥有路飞影子的恐怖僵尸奥兹也完全被月光·莫利亚控制，因为路飞没能及时打倒莫利亚，让莫利亚对奥兹下达了命令，奥兹转而开始攻击草帽海贼团等人。面对有史以来最强的僵尸，草帽海贼团陷入了空前的危机！
路飞虽然担心大怪物奥兹的攻击力,还是决定先追莫利亚抢回大家的影子,其他人则是同时面对到有着路飞战斗力的超强僵尸奥兹的攻击,尤其开始动手之后才发现奥兹不但身躯庞大速度也快得让人叹为观止。
娜美在罗拉拼命的相救下，总算逃离了阿布萨罗姆的魔掌，但是当她飞奔去找她的第二生命财宝时才发现被搬空了，另一方面，索隆等人为了对付怪物奥兹，在弗兰奇的建议下决定采取合体攻击，但是妮可罗宾觉得太丢脸不愿意配合。
山治他们好不容易扳倒了奥兹，没想到没多久，奥兹就再站了起来，弗兰奇原本想利用拖延战术等路飞抢回大家的影子就好，索隆和山治却坚持要打倒这个怪物，另一方面，娜美的面前出现了更可怕的敌人，王下七武海之一的巴索罗米·熊。娜美担心王下七武海之一的巴索罗米·熊目标也是路飞，急着要通知路飞，然而被莫利亚的影子骗得团团转的路飞不知在何处，更奇怪的是忙着对付难缠的奥兹的索隆等人，却从奥兹的体内听到了莫利亚的声音，莫利亚竟然在奥兹的肚子里。莫利亚的头脑再加上奥兹的身体,果然所向无敌让山治他们陷入苦战,后来乌索普和弗兰奇联手出招，弗兰奇差点被奥兹断送最后一口气，幸好娜美及时出现解救了危机，现在只剩下要去帮大家抢回影子的路飞还没回来，原来，他遇到了罗拉率领的海贼团，展开了一场恶梦。由于莫利亚和奥兹的合体，让除了路飞之外的其他所有成员都陷入了苦战，并且在莫利亚个个击破的方式下一个一个地倒下来，甚至连一向深思熟虑，且有莫诺保护的妮可·罗宾也不小心被夺走了影子，而乔巴和山治的联手出击也不是奥兹的对手。连最强的剑士索隆原本想要掩护乌索普，没想到自己先被击倒，而乌索普好不容易把能够净化僵尸的盐塞进奥兹的嘴巴里，却因为莫利亚事先做好防备而无效，就在连娜美和乌索普最后两人都快要被奥兹踩死之际时噩梦路飞出现了，路飞用体内一百个人的影子力量，好不容易击倒了奥兹，没想到没有痛感的奥兹即使受到重大冲击还是又站了起来，而路飞体内的力量已经消失并且变小，原本大家都以为草帽海贼团的成员都被打倒在地时，不料最后大家合力把奥兹真正地击败了。在奥兹被击败了后，莫利亚一气之下吸进了一千个人的影子力量，这是之前路飞一百个人力量的十倍，罗拉海贼团的人看到眼前可怕的敌人，只想逃回阴暗处躲起来，而草帽海贼团的成员则是毫不畏惧地决心要打败莫利亚。路飞好不容易打倒了莫利亚，在千钧一发之际救回了所有人的影子，让大家免于在阳光下消失的命运，没想到正当大家庆幸劫后余生时，又出现了一个可怕的敌人也是王下七武海之一的巴索罗米·熊，而且五老星还对他下达了抹杀掉所有人的命令。
路飞倒在地上，昏迷着，大家开始担心，再碰到厉害的敌人路飞还会像现在一样乱来吧，暗暗下定决心，不愿再让路飞一个人战斗。罗拉等人来感谢草帽一伙，大家沉浸喜悦里，这时娜美忽然想起在桑尼号上见过的那个恐怖的男人，急忙想告知大家，一道从围墙上传来的声音，彻底打破了喜悦，
“原来是这样。”众人看着这个体型庞大，拥有呈半圆形的耳朵的男子，他的膝盖上放着一本圣经，手中是一只电话虫，
“不祥的预感应验了吗。”
“好象是的。”
“那个人是谁？”
“在那……”娜美带着些哭腔，努力让自己镇定下来，莫诺看着那个男人，紧握住手上的水蛭，身体向前靠了靠，
“大家冷静点听我说，在和莫里亚他们战斗的时候，我忘记说了，这个岛上还有一个，”莫诺将大家护在身后，
“你来这里做什么，七武海？”大家吃惊的看着熊，
“七…七武海！”
“为什么一个岛上会有两个七武海！”
“大家小心点，他是被称为暴君的巴索罗米·熊。”听了熊和政府的通话，大家陷入了恐慌，政府下达了抹杀的命令。熊站了起来，索隆拔出鬼彻挡在大家面前，
“你们退下，我来对付。”明明因为刚才的战斗，身体负担很重，却一人挡在了伙伴们的面前，莫诺看着索隆，不愿看他一个人战斗，山治凝视着索隆，有些担忧，
“小心点，是什么能力者，我看见他摆了一下手，就能让人消失！而且自己会瞬间移动！”熊脱下手套，瞬间来到大家面前先击倒了一些海贼，又来到了莫诺面前，
“白衣鬼莫诺，先由你开始吧。”
“你的对手是我！”索隆一刀砍向熊，被熊轻易接了下来，
“海贼猎人，诺诺罗亚·索隆。上面对你们的评价可是,很高啊，听说在草帽小子的船上，有几个很有能力的手下啊，引起了不少骚动，不知不觉中开始扬名天下的，并不是只有船长一个人。”熊看着莫诺和索隆，莫诺冷静的观察着熊，分析着他的能力，手中的水蛭反射着一阵刀光，索隆将鬼彻放到左边握着，另一只手也握住了秋水，
“喂！莫诺，索隆，太勉强了！你们不是伤的很重吗！”乌索普有些担心的说着，山治看着两人没有说话，
“灾难总是接踵而至，这正是世间常理，你以为只要解释一下，就会有谁来救你吗？要是死了，就只能证明我不过是如此程度的男人。”莫诺看着索隆有些犹豫，山治走到莫诺身边，
“让那个笨蛋去吧。”莫诺点点头，放下了水蛭，
“二刀流，居合，罗生门！”熊刚才所站位置的一块巨石被劈开，而熊站在索隆旁边，一掌拍了下来，索隆急忙躲开，被拍到的土地上有一个巨大的熊掌印，熊看向索隆，一个透明的熊掌袭了过去，索隆急忙躲过，可是还是受了伤，
“看啊，对方明明还什么都没做，你就已经喘成那样了！”
“那家伙的能力到底是什么，可在瓦砾上的标志又是什么？”莫诺看着熊，对大家说到，
“是肉肉果实，弹开一切的能力。”
“肉肉果实？”山治皱着眉，继续看着，
“三十六烦恼风！”熊伸出左手，将刀气轻易地弹开了，
“说的没错，我是吃了肉肉果实的肉球人。”
“肉……肉球人？”
“真搞不懂他是七武海，还是慈悲为怀，说不定没什么大不了的？”话刚说完，弗兰奇就被击了出去，
“弗兰奇！”乔巴急忙跑了过去，
“人造人弗兰奇，你的强度仅此而已。”
“难道他在弹出大气，普通的大炮对弗兰奇是没有用的。”
“这是压力炮，能光速弹开物体。”没一会儿，索隆又被他弹开了，熊将手放到索隆上方，又想出招，山治急忙跑过去阻止，一脚踢在熊的下颚上，
“粗碎！”
“你小子凑什么热闹！”索隆看向上方愣住了，山治捂着脚，掉了下来，倒在地上，
“黑足山治，就是你吗？”莫诺将水蛭握在手里，
“这家伙怎么会怎么硬，脸是钢铁做的吗？”
“火鸟星！”熊将乌索普的攻击弹了回去，
“阻击王吗？真是狂妄自大的称号。”莫诺冲了上去，一刀劈向他，因为莫诺受伤，行动远没有原来那么敏捷，被熊轻易躲开了，
“海楼石制造的刀吗，的确是很少见，不过攻击不到，就没有意义了。”莫诺一个回转，刀又刺向熊，熊又躲了过去，抓住莫诺，一个压力炮，将莫诺弹了出去，莫诺重重的摔在地上，吐出一口血，
“莫诺！”莫诺的胸口上原本就还没完全愈合的伤口又撕裂了开来，血不断的的淌着，
“怎…怎么会，这样！”乔巴看着莫诺一脸的疑问，
伤口尽然比在司法岛上时看到的还要严重！
矢捂着伤口，想要站起来，
“看来你原本就受了足以致命的伤，不知道用什么方法让伤口表面变小了，现在受了我的压力炮，伤口又恶化了。”莫诺看着熊，用水蛭支撑着站了起来，
“就算消灭了衰弱到这等地步的你们也一点意思也没有，虽然政府是要我完全抹杀了你们。”熊举起双手不断拍打着他上方的空气，
“那是在做什么？”
“大气？他在聚集肉球形状的大气？”
“越来越小了……”
“他在用肉球的弹力给大气施加压力，尽然被压缩成那么小块了！”
“如此大量的大气恢复成原来形状的力量，足以发出巨大力量的冲击波形成炸弹。”
“什……什么！”莫诺看着越来越小的肉球，急忙收回刀，
“炸弹？也就是说他在制造炸弹吗？”
“炸弹……”熊将肉球压缩到手掌大小，
“我就饶你们一命，不过你们得把草帽小子路飞一人的人头交给我。”莫诺缓缓地走向路飞，身体摇摇晃晃的，留下一条血路，
“只要有了他的人头政府也就不会找茬了。”众人沉默许久，
“要让我们出卖同伴吗？”山治站了起来，莫诺一脸坚决的站在路飞身前，
“来吧，把草帽小子的人头交给我。”
“拒绝！！！”众人异口同声，
“太遗憾了……”肉球飞向众人，
“熊之冲击。”整艘船都淹没在冲击中，莫诺昏了过去，当他再醒过来的时候，只有熊，山治和索隆站在那里，
“好了，来拿吧，不要拿这家伙的，把我的命拿走吧。”山治站在索隆身前，身体不断的颤抖着，似乎受了很重的伤，莫诺想要站起来，可是他现在的身体能清醒着就已经是奇迹了，
“我可一直有着代替他的觉悟，就在这里让死亡的花朵绽放吧！喂，你告诉大家，就说…承蒙关照了。”索隆难过的看着山治，
这家伙……
“不好意思，看来厨师要另找了。”索隆用刀柄打晕了山治，山治紧紧抓着索隆的肩膀，
“你……你这家伙！”真是傻瓜……
山治倒了下去，
“这是我最后的请求。”索隆将三把刀扔在一边，莫诺焦急的看着他，不断的想要爬起来，
“这下还要对草帽下手的话，不知羞耻的应该是我了吧？”
“感激不尽。”
“相信我所做的事，我会遵守承诺的。”熊看着睁着眼死死盯着他，却丝毫不能动弹的莫诺，抓起了路飞。
“相对的就要让你…见识一下地狱。”熊从路飞的身体里弹出一以巨大的红色肉球，把路飞放回原地，
“刚在从这家伙身体里飞出来的是疼痛，以及疲劳，这是和莫里亚他们打斗后积攒下来的所有伤痛，既然你说要代替他，那就照你所说的接受这个痛苦吧，本来就濒临死亡的你，是不可能承受的住这个的，不过相对于那个躺在地上勉强清醒着的，你的胜算会大一点，不过结果是一样的，会死，试试看吧。”熊分出一个小球，一进到索隆的身体索隆就倒了下去，
“怎么样？”
“请让我换个地方。”索隆看着莫诺，轻轻说了一句，
“别告诉大家，拜托了。”莫诺闭上眼又昏了过去。
昏迷了整整一天，莫诺才勉强醒了过来，虽然经过乔巴的治疗，但是伤还是好的很慢，之后，布鲁克加入了草帽一伙，大家一起离开了恐怖三桅帆船，开始往鱼人岛方向出发,只是越接近那里莫诺就越不安，会发生什么吧，莫诺这样想着。
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