买个马公司位于西伯利亚的研究基地除了点事故，雇佣了从米国来的一只雇佣军队，就是贝克将军带领的雇佣军。他们的工作是扫除所有异形以及营救有价值的幸存者。但公司最核心的秘密不能让他们知道，所以买个马又雇佣了这方面的专家——主角去执行特殊任务。
异形不是这个世界的产物，买个马通过某种实验把它们从另一个世界召唤过来，原本以为他们只是极为低级的生物可以用来制造B.O.W（生化武器），不想这只是异形入侵这个世界的计划，异形发飙攻占了基地，利用基地的设施从母星召唤援军和武器装备，当然，也利用买个马公司的研究武装自己。
异形首领只是前线指挥官，失去了他，目前入侵地球的异形就只不过是一群没智商的爬虫。
K手里有关于异形的一些重要资料，这很正常，她是买个马的人（贝克不是）。这些资料应该和光盘有关，所以K被掠走后，买个马公司很不情愿暴露了自己的二号基地（原本只要一颗核弹解决的地方），让主角去拷贝资料（这样K牺牲也无所谓了）。当然，你也可以认为K什么都不知道，只不过和尼克莱有一腿（邪恶……），所以尼克莱假公司的名义要你去做……
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