镜头转回我们的萧同志那边。原本以为会过上好日子的萧辰，干开始过了几天的人类生活之后就过上了水深火热的生活。至于为什么？听我细细道来。话说萧辰的养父乃国联十二大仪员之一的沈应龙，在国联的十二大仪员里天朝占了三个，米国同样三个，德国俩个和俄罗斯两个日本一个，意大利一个。而萧辰的养父正好膝下无儿无女正好将萧辰看辰自己的亲生儿子，身为国联十二仪员之一兼国防部长做为军人出生的沈应龙又做为一名父亲，所以他人为小孩必须从小锻炼身体。见过不到一个月会走路的小孩吗?见过两个月就会讲话的小孩吗?沈应龙发现他的养子是个天才，嗯必须从小抓起。萧辰走向了水深火热的生活。他的训练很苦，不过他忍了下来行为他不想让他的父亲失望，重来没有享受过家的滋味有了，这个家让萧辰十分的珍惜这个来之不宜的家。他也知道曾经和为来要发生的事情。
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2000年9月13日，第二次浩劫（SecondImpact）发生。在南极大陆（二次元的）上发生了一起给地球带来巨大浩劫的异变，造成海面水位上升、地轴扭曲。如同恐龙灭绝的传说，巨大的陨石撞击地球之后灰尘遮盖天空，造成全球性气温下降。经济崩坏、民族纷争、内战……，世界人口急速减少，只剩下原来的一半。南极，成为了宁静的残亡地域。人类，并未象恐龙那样灭绝，但复兴的工作，却无比严峻。
2002年，源堂和冬月为了调查第二次浩劫的起因前往南极。国联正式发表公告，称2000年9月13日的世界规模的大灾害，是由于有超光速数倍的大质量陨石，冲击南极大陆所引致，其破害性相当于40亿年前的地球与小行星的撞击。但对于造成第二次浩劫的原因，却无人知晓。现实毕竟难以掩盖，在专家圈内，流传着一些保留下来的照片，在冲击造成的光影中，有一个巨人般的影像。也有在南极等地的幸存者称，在冲击波浪的中心，有数对巨大的翅膀。因第二次浩劫受到惊吓而陷入自闭状态的美里，被国联保护。
2003年，国联完成了对南极的调查，根据调查结果设立了位于箱根的人工进化研究所。冬月首次探访人工进化研究所，之后开始协助源堂。在人工进化研究所的地下有个广大的球形巨大空洞，而NERV本部就利用这个空洞而建造。此时，E计划始动，零号机也开始建造了。
PS﹕字数是少了点但是我很努力了。关于女主的问题，本篇女主有三个分别是﹕绫波丽明日香和希波
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