上古之战中，由于魔影军团第七将军的偷袭和初代皇家骑士团内部出了奸细，导致初代皇骑团几乎全军覆没：中世纪公爵兽坠入空间乱流一直生死不明，马格纳兽X，八脚马兽X，领主骑士兽X，君主兽X，颅骨兽X，杜夫特兽X，艾克萨兽X，究极V龙兽未来形态，甚至拥有强大隐藏力量的顽固兽，以及手持十只战斗暴龙兽X的龙兽杀手做成的战刃＂龙血＂，号称弑龙骑士＂的巴斯比雷亚兽在内全部阵亡。关键之时，初代皇家骑士团长在被魔影军团首领和七将军围攻的情况下，用最后的力量发动空间转移术，将重伤的副团长奥米加兽X传送回了皇家骑士总部，而一同活下来的只有带领援军奥林匹斯十二神和与之暂时协商的初代七大魔王前去支援，却在半路被拦截的阿尔法兽。
那一战后，皇家骑士团经过数百年的修养才恢复元气，但其总体战斗力已是大不如前，无奈，被人工智能化的世界树用人的思维得出了用数量弥补质量的方法，于是皇家骑士就有了骑士，龙，天使，恶魔四个军团，皇家骑士团几乎已是名存实亡。
按理说，当时的魔影军团完全可以乘胜追击彻底消灭自己的所有敌对实力，因为在当时，即使阿尔法兽和奥米加兽X与奥林匹斯十二神，古代十斗士，七魔王，五番长，四圣兽联手，哪怕是世界树亲自出动，也绝不会是魔影军团的对手。
但是，魔影军团却在这几百年内都没了一点动静，若不是偶尔有一些小兵偷偷摸摸的溜出来，几乎所有人都要忘了这个庞大的势力了。
世界树以为对方要有什么一举歼灭的大动作，于是与其他所有势力派出了全部可利用的人手前去调查，却是没有调查到一点信息，数码世界甚至还有一段时间人心惶惶，声称魔影军团将要统治数码世界，惹得病毒种数码兽纷纷前去参加魔影军团，应征的队伍从总部排到了黑暗之海，疫苗种数码兽纷纷自杀，创始村工作人员纷纷表示压力太大而辞职不干，资料种数码兽全都精神抑郁得了人格分裂。数码世界一时混乱不堪，而魔影军团的这段历史，也成为了只有他们内部成员才知道的秘密。
骄傲使人失败，相信魔影军团当年的首领一辈子都不会忘了这句话。
当时他的脑中出现了一个在他看来很伟大，实践证明很傻叉的想法：去征服其他未知的次元。
于是悲剧的七将军被忽悠着上了路，自此魔影军团七将军成为了一段杯具的历史和一个无畏的革命神话。
第七将军在顶上战争中先被黄猿踢飞又被赤犬攻击。
第六将军遇到了一位名为御坂美琴的少女。
第五将军和一同前去的第一将军分开行动，一个被究极断头刃切成两半，一个被凯撒贝利亚塞进了百万格斗仪，刚出来喘口气又被赛罗秒杀。
第四将军被解除妖力抑制装置的悟空虐杀。
第三将军先被暴走八神打了个半死，又顺便和再度被封印的大蛇一起走了。
第二将军刚踏出时空门，便被一招名为尾兽玉的招数击飞，那招的始作俑者是一只名为十尾，长的异常奇葩的尾兽。
魔影军团首领据说当天被气的设错了时空坐标，回来后被一个叫孙悟空的超级塞亚人一拳打成了重伤。
所以说这段奇异的空白历史中任何一个势力其数都能灭了魔影军团==
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