1个星期后，也许是更久，小飞和小霞等4人1胖丁终于从树林里钻了出来，到达了枯叶市。此刻的四人很是狼狈，小霞则撒娇似的拉扯着小飞走前面，抱怨道：“如果不是因为你要抓那只鸭嘴火龙，我们又怎么会迷路。”“有什么关系嘛，反正都抓到了，你就不要在抱怨啦。”“可也因此让我们在森林里多转了好几天才出来！”“总之，对不起了。”“认识到错误就好，我要赶紧找个地方舒服的洗个澡，睡一觉！”“恩，也是。”和小智等人来到了精灵中心后，小飞也松了口气！！在不断的战斗中虽然云彩鸟提升很快，但也受了很重的伤。愉快的吃过了午饭，领回了神奇宝贝，就一起前往枯叶道馆了“小飞，你得到了几个徽章？”走在前面的小智问起了小飞。“徽章吗？已经得到3个了。”“比我多一个。”小智失落道：“既然这样，我一定要比你先得到枯叶徽章，这样就能跟你得的徽章数一样了。”“可是小飞也会得到枯叶徽章啊，那不还是比你多一个。”小霞好心提醒道。“能够一时得到的徽章数相同也行啊。”小智开心道。真是开朗的人，这么丢人的事也说的很高兴，小刚和小霞一起大摇其头，小飞却只是微微一笑。
来到了枯叶道馆。5人一起进去，小智走在最前面。迎面的是一男一女两个道馆喽罗。“喂喂喂，小孩子还是回家去找妈妈吧。”那个男的说道。“我们可不是小孩，我们是来挑战道馆的！”小智喊道。“哦！是谁来挑战我。”从后面走来一个很高的人，是馆主马奇士。他一过来就想拥抱小霞，小飞一下站到了小霞前面：“挑战着是我和小智。”让小霞心里一阵温暖。“哦，是吗，那谁先来。”马奇士说道。“我先。”小智说道。经过一番罗嗦，马奇丢出了宝贝球，在白光过后，一只胖胖的雷丘出现在了场地上。“哎，小智还是没有多少长进啊。”小霞看着只能挨打的比卡丘，嘀咕道。“已经不错了，至少还有得拼，不过战胜对手似乎还有些难啊。”小飞知道结果，却也装不知道。正当雷丘要给皮卡丘最后一击的时候，场地中突然出现了一只紫色的凯西，竟用瞬间移动救了皮卡丘，自己也进化成了勇吉拉。
“皮卡丘，鼠神奇宝贝，电神奇宝贝，皮丘的进化型。脸上的电气袋储存着电力，警戒心很强，常常举起尾巴来探测四周是否安全。会电击第一次看到的东西，烧焦的树果能证明皮卡丘没有把握好电流的强度。”
“雷丘，鼠神奇宝贝，电神奇宝贝，皮卡丘的进化型。电气袋中电过多的时候把尾巴贴在地上放电，在它的巢穴附近经常能看到烧焦的痕迹。”
“勇吉拉，念力神奇宝贝，凯西的进化型。勺子可以帮助它提高念力，据说未携带勺子时只有一半的念力。”
“你怎么能插入我们的战斗。”“谢谢你，小飞。”“快把皮卡丘送到神奇宝贝中心去吧。”“好。”说完小智就抱着皮卡丘跑了出去。“好了，轮到我了，馆主。”小飞说道。“你会用什么宝宝呢？是那只刚进化的勇吉拉吗？小心，我的比赛是很快的。”马奇士说道。“我知道，我的比赛也很快。”小飞毫不示弱。“上吧，化石翼龙！让它见识见识你的实力吧！”“吼！”随着一声怒吼，化石翼龙出现在了雷丘面前。“什么！你竟然有化石翼龙！”“算了，不用比了，我认输。”“为什么？”小飞问到“废话，我的雷丘是绝对打不赢你这只化石翼龙的，硬着战斗只会让雷丘受伤，这是徽章，拿去吧！”说完抛出一枚菊色徽章。
之后3人一起回神奇宝贝中心。小刚去看受伤的比卡丘，小飞则和小霞再次跟大木博士取得了联络。
“是你啊，阿飞，怎么样了，到哪了啊？”大木博士问道
“博士，我刚刚得到枯叶市的菊色徽章，对了博士，我想调整一下，把携带数量从6只改到12只，可以吗？”
“可以，你把图鉴插到那个孔里吧。”
“开始调整。”过了一会儿，博士说道：“好了，调整完毕。”
“谢谢博士，请你帮我把豪力和波克基古还有比雕传送给我。”
“好，你等一下啊。”……
“让你们久等了！”小智高兴的走了过来，比卡丘也兴奋的跟在边上，“你们看！”他说着亮出了手中的菊色徽章。四人继续一起旅行，目标是离枯叶市并不远的枯叶港，小飞一路上跟小霞和小刚谈着神奇宝贝的知识，小智一个人兴奋的领着比卡丘走在队伍的最前面。几个小时后，他们到达了美丽的海边港口。看着巨大的客轮，几个人商量之后知道坐不起这艘船都露出了失望的表情。这时，两个黑皮肤少女拦住了几人的去路，经过一系列的推销，几张船票塞到了小智的手上。“原来真有这么好的事啊。”小霞惊讶的看着船票道。小飞却知道他们是火箭队的。
经过了一番寻找，在港口的另一边，几人找到了小很多的圣安奴号。登上了船，一个巨大的宴会出现在了几人面前，让第一次参加这种宴会的人都兴奋了起来，船上有不少神奇宝贝训练家，他们互相的比着自己喜欢的神奇宝贝，还有绅士的拉达对少年宝石海星的比赛。没过了多久，绅士便和小智开战了，也想用拉达和小智换神奇宝贝，一切都按着剧情发展着。正准备去餐桌上装点食物，一个卖鱼的老头叫住了小飞，推销起了可以产黄金之卵的鲤鱼王，小飞没有理会他，也只有小次郎那样智力差好几个次元的人才会买。没过多久，火箭队开始行动了，之后就是训练家们狂殴火箭队，小飞懒得出手。小飞趁乱跑回了客房中。“这艘船碰到暴风雨，马上就要沉了！”小飞听到有些乘客叫到。
小飞向船底走去，他要赶在小智等人打破船底之前赶到，不然到时候就真的要永远沉到海底去了。刚爬上了两层，整个船却剧烈的晃动了起来，虽然知道没事，但是小飞还是一阵担心，现在船可是就一个点支撑着，掉下去可就是无尽的深渊呀。“步犁！”跟在一边的胖丁突然感觉到什么，向一个方向跑去，小飞也只有紧紧的跟着它，能在这里遇到的也就只有小智一伙人了。果然，没走多远，小智的声音就从远处传来。他们是追着比卡丘跑过来的，没想到会在这里碰到阿飞，比卡丘和胖丁这两只神奇宝贝的耳朵都很敏锐，互相知道了对方的存在才跑到了一起。
“知道现在往哪里走吗？”阿飞道。几个人点点头，小霞解释道：“一直走下去就是动力室了，那里的甲板比较薄，我们可以在那里想办法逃出去。”在妙蛙种子藤鞭的帮助下，所有人都顺利通过了动力室前的火焰。到达了动力室后，小智放出了小火龙，让它在船底开个洞，看到这只小火龙，小飞想到了它就是那只在24号公路被遗弃的那只，还好仍然选择跟了小智。（路线一样，小飞也遇到了，不过他自己有喷火龙了，也就没收服）想到等下要游出去，小飞拿着绳子把小霞和他绑到了一起，另一头，他用上了可达鸭和进化成水精灵的伊布，接着就是等着看小火龙的表现了。很快，除了火箭队，大家都用绳子把人跟神奇宝贝绑到了一起。船底的铁板顺利的被烧出了一个洞，海水迅速的流了进来。“我要先去了，小智，你也抓捞咯，胖丁。”小飞说完冲几个人点了点头。小飞小霞小智小刚都顺利逃了出来。
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